Νέα μέθοδος ανάλυσης της συνεργασίας μεταξύ των βακτηρίων επιτρέπει την ακριβέστερη πρόβλεψη βιολογικών χαρακτηριστικών και συνηθειών
Μια πρόσφατη μελέτη που δημοσιεύθηκε στο περιοδικό Communications Biology αποκαλύπτει ότι η ανάλυση των δικτύων συνεμφάνισης (co-abundance) των βακτηρίων του εντέρου μπορεί να προσφέρει έναν πιο ισχυρό τρόπο πρόβλεψης χαρακτηριστικών υγείας, ηλικίας και τρόπου ζωής, σε σχέση με τις παραδοσιακές μεθόδους που βασίζονται μόνο στην αφθονία τους.
Οι ερευνητές, αναλύοντας τα δίκτυα συνεμφάνισης σε 938 υγιείς ενήλικες, ανακάλυψαν πώς οι παράγοντες του τρόπου ζωής επαναπρογραμματίζουν διακριτικά τις σχέσεις μεταξύ των βακτηρίων.
ΔΕΙΤΕ ΕΠΙΣΗΣ | Ακατάσχετοι εμετοί από τροφική δηλητηρίαση στους παίκτες ομάδας πριν από κρίσιμο αγώνα – Υποψίες για μολυσμένη σαλάτα
ΔΕΙΤΕ ΕΠΙΣΗΣ | Σόγια: Τελικά προστατεύει ή προκαλεί καρκίνο του μαστού;
Το μικροβίωμα του εντέρου είναι ένα πολύπλοκο οικοσύστημα, όπου οι επιμέρους κοινότητες βακτηρίων συνεργάζονται ως μια συνεκτική λειτουργική ομάδα. Η εξερεύνηση αυτής της λειτουργικής συνδεσιμότητας και της συνεμφάνισης των ταξινομικών ομάδων μπορεί να εντοπίσει χαρακτηριστικά που οι απλές μονομεταβλητές προσεγγίσεις θα έχαναν.
Για να μελετήσουν αυτές τις σχέσεις, οι επιστήμονες χρησιμοποίησαν μια νέα στατιστική μέθοδο, την MANOCCA (Multivariate Analysis of Conditional Covariance Analysis). Η MANOCCA διερεύνησε τις συσχετίσεις μεταξύ 80 περιβαλλοντικών παραγόντων (χαρακτηριστικών του ξενιστή) και της συνεμφάνισης των ταξινομικών ομάδων σε επίπεδο οικογένειας, γένους και είδους.
Ισχυρή πρόβλεψη για ηλικία και τρόπο ζωής
Η μέθοδος MANOCCA αποκάλυψε σημαντικές συσχετίσεις της συνεμφάνισης των βακτηρίων με τέσσερις βασικούς παράγοντες: το φύλο, την ηλικία, το κάπνισμα (σε όλα τα ταξινομικά επίπεδα) και τον δείκτη μάζας σώματος (BMI) (σε επίπεδο γένους).
ΔΕΙΤΕ ΕΠΙΣΗΣ | Το μυστικό των αρτοποιών για να ξαναζεστάνουμε το μπαγιάτικο ψωμί χωρίς να ξεραθεί
ΔΕΙΤΕ ΕΠΙΣΗΣ | Συγκομιδή λεμονιών με drones και ρομπότ – Εντυπωσιακές εικόνες
Αν και οι διατροφικοί παράγοντες είχαν μια μέτρια συστηματική επίδραση στο δίκτυο αλληλεπίδρασης των ταξινομικών ομάδων, η ικανότητα πρόβλεψης ήταν το πιο αξιοσημείωτο εύρημα.
Το μοντέλο πρόβλεψης που βασίστηκε στη συνεμφάνιση ήταν σημαντικά πιο ακριβές από ένα τυπικό γραμμικό μοντέλο που βασίζεται στη σχετική αφθονία των βακτηρίων. Συγκεκριμένα, το κέρδος στην πρόβλεψη ήταν ιδιαίτερα μεγάλο για την ηλικία, με τριπλάσια βελτίωση σε σχέση με τα μοντέλα που βασίζονται στην αφθονία. Διαπιστώθηκε επίσης σημαντική επικάλυψη στις αλληλεπιδράσεις που επηρεάζονταν από τον Δείκτη Μάζας Σώματος και το φύλο, καθώς και από το κάπνισμα και την ηλικία.
